Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC39AQ5SRH9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms