Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL12Q53G59 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms