Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL4A6Q14031 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms