Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNX3Q13761 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms