Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FOXD4Q12950 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXD4Q12950 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms