Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 RPS3A-206ENST00000507485 1526 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.981e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.081e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.541e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-214ENST00000515818 572 ntTSL 54.94□□□□□ -1.621e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-211ENST00000512797 686 ntTSL 24.44□□□□□ -1.71e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-205ENST00000507327 674 ntTSL 23.34□□□□□ -1.871e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.881e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-213ENST00000515792 671 ntTSL 33.3□□□□□ -1.881e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 SH3D19-209ENST00000514013 557 ntTSL 49.03□□□□□ -0.962e-6■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 SH3D19-206ENST00000474743 659 ntTSL 48.42□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.328e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.458e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 SRP54-213ENST00000556994 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.748e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 SRP54-208ENST00000555557 1949 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.828e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-19■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 515.32■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MINK1-204ENST00000571207 4569 ntTSL 514.55□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 NDUFV3-201ENST00000340344 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.026e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.931e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ADNP-205ENST00000534467 773 ntTSL 35.29□□□□□ -1.561e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.248e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.528e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.089e-15■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.329e-15■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 AL359915.2-204ENST00000413531 1154 ntTSL 1 (best)6.05□□□□□ -1.449e-15■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 SMG6-218ENST00000575454 652 ntTSL 39.05□□□□□ -0.963e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 SMG6-208ENST00000570874 533 ntTSL 43.29□□□□□ -1.883e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 PDXK-215ENST00000476313 1704 ntTSL 319.85■□□□□ 0.776e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.016e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 PDXK-207ENST00000438837 342 ntTSL 38.81□□□□□ -16e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.462e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.482e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 PUS10-206ENST00000602599 6366 ntTSL 1 (best)4.55□□□□□ -1.682e-7■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ANXA2-203ENST00000421017 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.92e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ANXA2-204ENST00000451270 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -12e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ANXA2-205ENST00000504475 3528 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 ANXA2-228ENST00000560014 2339 ntTSL 28.11□□□□□ -1.112e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 PSPC1-208ENST00000635562 422 ntTSL 32.6□□□□□ -1.993e-6■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.584e-9■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.074e-9■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-9■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.234e-9■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-9■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -14e-9■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.054e-9■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 MARK3-223ENST00000561071 746 ntTSL 36.94□□□□□ -1.34e-9■■■□□ 18.5
ILF3Q12906 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FBXO17-203ENST00000596025 935 ntTSL 219.63■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.721e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 APOH-204ENST00000585162 407 ntTSL 23.29□□□□□ -1.885e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 EPB41-203ENST00000349460 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 18.4
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ILF3Q12906 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.227e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.327e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.857e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 29.01□□□□□ -0.977e-7■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 STAG1-204ENST00000462818 1227 ntTSL 35.65□□□□□ -1.57e-7■■■□□ 18.4
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ILF3Q12906 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.921e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -11e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GIGYF2-220ENST00000440945 2658 ntTSL 1 (best)8.33□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.41e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 GIGYF2-210ENST00000424038 626 ntTSL 35.98□□□□□ -1.451e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 MOB3A-204ENST00000589902 730 ntTSL 417.94■□□□□ 0.463e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 MOB3A-205ENST00000591236 556 ntTSL 516.82■□□□□ 0.283e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.163e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-208ENST00000470171 746 ntTSL 215.41■□□□□ 0.064e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-205ENST00000465559 677 ntTSL 315.32■□□□□ 0.044e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-213ENST00000489003 976 ntTSL 214.95□□□□□ -0.024e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-210ENST00000474345 713 ntTSL 314.95□□□□□ -0.024e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.024e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.054e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-216ENST00000491013 912 ntTSL 514.58□□□□□ -0.084e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 PIP4K2B-201ENST00000613767 478 ntTSL 414.22□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 MOB3A-203ENST00000588048 451 ntTSL 414.02□□□□□ -0.173e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-219ENST00000495308 808 ntTSL 213.43□□□□□ -0.264e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.323e-6■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-207ENST00000468479 938 ntTSL 212.8□□□□□ -0.364e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-204ENST00000461507 1022 ntTSL 212.58□□□□□ -0.44e-8■■■□□ 18.4
ILF3Q12906 FDPS-211ENST00000477057 741 ntTSL 212.57□□□□□ -0.44e-8■■■□□ 18.4
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