Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC173Q0VFZ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms