Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms