Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACTN3Q08043 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN3Q08043 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms