Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms