Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELAQ04206 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELAQ04206 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RELAQ04206 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELAQ04206 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELAQ04206 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms