Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms