Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPCQ01831 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPCQ01831 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XPCQ01831 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms