Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2L3P68036 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms