Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms