Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms