Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM258P61165 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms