Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB2AP61019 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms