Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRP6P59044 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms