Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LUMP51884 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LUMP51884 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LUMP51884 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LUMP51884 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LUMP51884 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LUMP51884 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LUMP51884 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LUMP51884 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LUMP51884 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LUMP51884 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LUMP51884 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms