Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPC3P51654 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPC3P51654 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC3P51654 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC3P51654 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC3P51654 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC3P51654 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC3P51654 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC3P51654 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPC3P51654 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPC3P51654 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms