Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC34P49427 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC34P49427 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC34P49427 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC34P49427 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC34P49427 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC34P49427 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC34P49427 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC34P49427 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC34P49427 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms