Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPHP41219 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPHP41219 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPHP41219 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPHP41219 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPHP41219 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPHP41219 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPHP41219 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPHP41219 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms