Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNCP24863 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNCP24863 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNCP24863 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNCP24863 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNCP24863 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNCP24863 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNCP24863 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNCP24863 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNCP24863 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNCP24863 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNCP24863 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNCP24863 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms