Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNFSF4P23510 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms