Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB4AP20338 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms