Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms