Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKBP12277 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKBP12277 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKBP12277 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKBP12277 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKBP12277 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKBP12277 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKBP12277 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKBP12277 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CKBP12277 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKBP12277 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKBP12277 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKBP12277 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CKBP12277 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms