Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHOX2AO14813 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PHOX2AO14813 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms