Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX1C9JBD0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms