Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRM5B3KS81 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRM5B3KS81 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms