Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NOTOA8MTQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms