Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC4A6NH21 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms