Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms