Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01539-201ENST00000587904 2068 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PTPRM-203ENST00000400060 5030 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 C15orf53-201ENST00000318792 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TTC39C-203ENST00000540918 4117 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SLC30A8-202ENST00000456015 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 FBXL2-222ENST00000538892 2793 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 KCNH6-205ENST00000583023 3821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 NELL2-212ENST00000549027 3036 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RSPH4A-203ENST00000368581 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC026362.2-201ENST00000624878 5566 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CDY15P-201ENST00000421995 1570 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AHCYL2-208ENST00000474594 2047 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CEP57-202ENST00000325542 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 POTEKP-201ENST00000397487 2688 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC063949.2-201ENST00000508671 1968 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LCN1-201ENST00000263598 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PDCL3P6-201ENST00000429744 706 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01501-203ENST00000449990 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CENPS-202ENST00000462462 584 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RN7SL337P-201ENST00000462468 301 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL672142.1-201ENST00000482796 378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AP001767.3-201ENST00000533329 436 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CACNA1C-AS2-201ENST00000545526 609 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC138123.3-201ENST00000551928 791 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC008569.2-201ENST00000589702 889 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 DMKN-268ENST00000602781 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC005796.1-201ENST00000623214 433 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC132825.5-201ENST00000640603 310 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC245100.4-207ENST00000640776 1082 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AKAP4-202ENST00000376064 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TMPRSS4-220ENST00000618855 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TUBB1-201ENST00000217133 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PLCD4-203ENST00000432688 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 LINC00243-201ENST00000399196 2052 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 KIAA1217-208ENST00000396446 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SEPSECS-202ENST00000382103 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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MKRN4PQ13434 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC025283.2-203ENST00000618352 2905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 POU3F4-201ENST00000373200 3878 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RAF1P1-201ENST00000508566 1696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SCGB1D2-201ENST00000244926 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TTTY8B-201ENST00000328819 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TTTY8-201ENST00000329684 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 MRPL55-216ENST00000366744 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 RHBDD1-203ENST00000409053 538 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 Z93930.2-205ENST00000422972 409 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 AL589935.1-204ENST00000423255 407 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 UGT1A13P-201ENST00000424780 762 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
MKRN4PQ13434 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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