RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
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RNU6-38P-201ENST00000384085 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RNU6-38P-201ENST00000384085 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
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RNU6-38P-201ENST00000384085 FOXD1Q16676 465 aa14.47□□□□□ -0.09
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.38□□□□□ -0.11
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADRA2BP18089 450 aa13.83□□□□□ -0.2
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RNU6-38P-201ENST00000384085 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RNU6-38P-201ENST00000384085 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.4□□□□□ -0.42
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.33□□□□□ -0.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNA4P22459 653 aa12.2□□□□□ -0.46
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RNU6-38P-201ENST00000384085 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
RNU6-38P-201ENST00000384085 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.97□□□□□ -0.49
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.68□□□□□ -0.54
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RNU6-38P-201ENST00000384085 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
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RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC4A2P04920 1241 aa11.44□□□□□ -0.58
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RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBTB22O15209 634 aa11.2□□□□□ -0.62
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RNU6-38P-201ENST00000384085 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.15□□□□□ -0.62
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RNU6-38P-201ENST00000384085 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.04□□□□□ -0.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
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RNU6-38P-201ENST00000384085 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.87□□□□□ -0.67
RNU6-38P-201ENST00000384085 DSG3P32926 999 aa10.86□□□□□ -0.67
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RNU6-38P-201ENST00000384085 OSCARQ8IYS5 282 aa10.38□□□□□ -0.75
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RNU6-38P-201ENST00000384085 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.25□□□□□ -0.77
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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RNU6-38P-201ENST00000384085 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RNU6-38P-201ENST00000384085 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.13□□□□□ -0.79
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RNU6-38P-201ENST00000384085 PITPNM1O00562 1244 aa10□□□□□ -0.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLEC11AQ9Y240 323 aa10□□□□□ -0.81
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RNU6-38P-201ENST00000384085 PROM2Q8N271 834 aa9.87□□□□□ -0.83
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.84□□□□□ -0.83
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RNU6-38P-201ENST00000384085 MIER1Q8N108 512 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 CREBZFQ9NS37 354 aa9.67□□□□□ -0.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.66□□□□□ -0.86
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLEKHG5O94827 1062 aa9.63□□□□□ -0.87
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RNU6-38P-201ENST00000384085 EVX2Q03828 476 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHL34Q8N239 644 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 LHX8Q68G74 356 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.42□□□□□ -0.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RNU6-38P-201ENST00000384085 RASEFQ8IZ41 740 aa9.38□□□□□ -0.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUBP1P53384 320 aa9.37□□□□□ -0.91
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPOCK2Q92563 424 aa9.35□□□□□ -0.91
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