Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF3C3Q9Y5Q9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms