Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFDP1Q9UEE9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CFDP1Q9UEE9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms