Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RTEL1Q9NZ71 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTEL1Q9NZ71 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms