Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKN2AIPQ9NXV6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms