Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPMQ9NSP4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms