Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFGAP3Q9NP61 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFGAP3Q9NP61 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms