Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPF2Q9H7B2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPF2Q9H7B2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPF2Q9H7B2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPF2Q9H7B2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPF2Q9H7B2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPF2Q9H7B2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPF2Q9H7B2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPF2Q9H7B2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms