Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP1Q9GZU7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP1Q9GZU7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms