Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP6Q9GZR1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms