Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms