Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDFIP1Q9BT67 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms