Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC39A3Q9BRY0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC39A3Q9BRY0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms