Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FYCO1Q9BQS8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms