Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN18Q99952 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN18Q99952 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms